重庆市生物化学与分子药理学实验室是市教委2000年批准的市级重点实验室，依托于重庆医科大学药学院。实验室现有科研仪器设备共243台/套，总资产1700余万元，实验场地1300平方米。
经过近20年建设，实验室已形成稳定的研究方向，主要包括：神经精神药理、炎症与免疫药理、心血管药理和肿瘤药理。实验室拥有一支长期在药物基础与应用研究中建立起来的多学科、梯队合理的学术队伍。现有固定人员43人，客座教授10人。在固定人员中，正高级专业技术人员14人，副高级专业技术人员18人，博士生导师8人，硕士生导师29人；具有博士学位33人，17人曾出国进修1年以上；3名专家教授入选重庆市高等学校优秀中青年骨干教师资助计划。40岁以下研究骨干13人，占比30%，多为从北大、清华等“985”、“211”高校引进的博士毕业生，具有较强的科研能力。
近五年来，各研究方向都取得较好的成绩，在国际与国内相关领域产生一定影响。实验室共承担科研项目72项，包括国家自然科学基金面上项目21项，省部级课题32项（含厅局级14项），横向课题5项等，获得课研经费1127.4万元。发表标注重点实验室的论文204篇，其中SCI收录论文112篇。申请和获得国内发明专利18项。以主编和参编身份出版专著11部。共培养研究生224人，其中硕士研究生201（已毕业128人），博士研究生23人（已毕业12人）；获市优秀硕士论文9人次，获校优秀硕士学位论文奖24人次，获校优秀博士学位论文奖1人次，获国家奖学金49人次，获重庆市优毕业研究生2人次。除进行科学研究外，实验室人员还积极进行社会服务，参与或指导企业的科研活动，促进专利成果转化与转让。
在新的历史时期，实验室将继续着眼于生命科学前沿，主要从事疾病的发生机制、预防和治疗研究。依托药理学，并利用交叉学科的优势，持续不断地以发现疾病预防和治疗新靶点及新药物为宗旨，产生具有一定国际影响的原创成果。同时，坚持以科学研究引领学科发展，培养该领域的创新人才。将实验室建设成为西南地区比较领先的新药创制基地，及西南地区高层次新药研究人才培育高地；进一步建设成国内领先的药物创制与药物研发人员的培育基地。
