学院现有博士生导师16人，硕士生导师72人，兼职博士生导师3人，兼职硕士生导师8人，行业导师29人（含17名附属医院导师）。拥有药学一级学科博士后科研流动站、药学一级学科博士点（2018年）、全国首批药学硕士专业学位授权点（2010年），可招收药理学、药物化学、药物分析学、药剂学、微生物与生化药学5个二级学科方向的学术学位研究生，以及工业药学、临床药学、管理药学领域的药学专业学位研究生。目前，学院招收博士后5-10人/年、博士研究生10-15人/年、全日制学术学位研究生50-60人/年、全日制专业学位研究生60-70人/年、在职研究生10-20人/年；近五年，研究生整体就业率接近100%。

学院建设有“新靶标与化学干预教育部医药基础研究创新中心”“重庆市药物代谢研究重点实验室”“重庆市生物化学与分子药理学重点实验室”“重庆高校药物工程研究中心”“重庆市药效评价工程技术研究中心”“原料药质量控制与安全评价重庆市重点实验室”6个省部级科研平台；建立了“创新药物及辅料分析测试技术研究中心”“药物制剂与纳米医药技术研究中心”“化学药物设计与合成实验室”“药物政策与评价研究中心”等4个院级平台；和附属医院8个国家药物临床试验机构有机链接，形成了覆盖从药物临床前研究到临床研究全链条的科研平台，实验室总面积2万余平方米，拥有核磁、质谱等设备价值1.1余亿元。此外，学院还与福安药业集团重庆礼邦药物开发有限公司、重庆康洲大数据有限公司、重庆国际生物城开发投资有限公司、重庆药友制药有限责任公司、重庆美莱德生物医药有限公司、西南药业股份有限公司共建了6个省级研究生联合培养基地，可为研究生科研、学习提供良好的资源保障。（更新时间：2024-05-17）