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药学院围绕药物的研究、开发和应用,侧重于神经精神药物、抗肿瘤药物、炎症药物、纳米药物等的新理论、新技术、新产品研究,取得了一批具有国际先进水平的科研成果。组建了“神经精神药物研发团队”、“肿瘤药物研究团队”、“炎症和免疫药物研发团队”、“纳米药物研发团队”和“非专利药物新工艺和创新药物研发团队”5个科研团队。学院高度重视产学研的有效结合,与制药企业、科研院所建立了良好的合作关系。近五年来,获得国家自然科学基金、教育部和重庆市科委等纵向课题以及企业委托横向研究项目近百项,经费约6000余万元;申请发明专利43项,获得发明专利授权22项;发表科研论文537篇,被SCI、EI、ISTP等检索系统收录101篇。