洪世垣，教授，博士生导师。2000年南京大学本科毕业。2002年在俄亥俄迈阿密大学获得生物物理硕士学位，2009年在凯斯西储大学获得生理与生物物理专业博士学位。2009-2016年在西北大学医学院微生物系担任副研究员，2016-2019年任西北大学研究助理教授，2019年加入重庆医科大学生命科学院。

主要研究分两个方向：1.人乳突病毒（HPV）的复制机理以及和宿主细胞的相互作用；2.HPV相关性疾病的发生发展。HPV目前所发现的种类已经超过四百种，可导致宫颈癌、其它生殖性癌症、头颈癌以及皮肤疾病。目前我们对HPV如何入侵人体，完成其复制，并且导致癌症形成知之有限。为此课题组现阶段的研究重点为HPV病毒复制的分子机制及其相关癌症形成的成因。已知HPV可通过不同机制影响人体先天免疫反应从而在分层上皮组织的基底层细胞建立持续感染。HPV通过宿主细胞的分化实现其依赖于DNA损伤反应的病毒复制。同时，DNA损伤反应又能引起基因组不稳定从而促进癌症的形成。而免疫反应中炎症反应在癌症发生发展过程中也起到了重要作用。因此，研究先天免疫反应和DNA损伤反应对研究HPV复制及其相关癌症的形成显得尤为重要。现阶段实验室主要致力于探索DNA损伤反应在调控病毒相关的免疫异常以及对HPV相关癌症形成的调控作用。主要成果发表在PLOS Pathogens，Oncogene，Cancer Research，mBio，Journal of Virology等期刊。

联系方式：电话：023-68486632邮箱：hongshiyuan@cqmu.edu.cn

近五年代表性论文：（*代表通讯作者或者共同通讯作者，1代表共同第一作者）

1.Cen Yixuan, Fang Yifeng, Ren Yan,Hong Shiyuan*, Lu Weiguo*, Xu Junfen*. (2022) Global characterization of extrachromosomal circular DNAs in advanced high grade serous ovarian cancer. Cell Death Dis. 2022 Apr 13;13(4):342. doi: 10.1038/s41419-022-04807-8. PMID: 35418185 PMCID: PMC9007969

2.Kaminski Paul1,Hong Shiyuan1*,Kono Takeyuki, Hoover Paul, Laimins Laimonis. (2021) Topoisomerase 2β Induces DNA Breaks To Regulate Human Papillomavirus Replication. mBio. 2021 Feb 9;12(1):e00005-21. doi: 10.1128/mBio.00005-21

3.Hong Shiyuan*, Li Yan, Kaminski Paul, Andrade Jorge, LaiminsLaimonis*. (2020) Pathogenesis of human papillomaviruses requires the ATR/p62 autophagy-related pathway.mBio 2020 Aug 12;11(4):e01628-20. doi: 10.1128/mBio.01628-20

4.Luo Ying,Hong Shiyuan*. (2020) The Role of Ataxia Telangiectasia Mutant and Rad3-Related DNA Damage Response in Pathogenesis of Human Papillomavirus. Pathogens 2020, 9(6), 506; https://doi.org/10.3390/pathogens9060506

5.Hong Shiyuan*, Xu Junfen, Li Yan, Andrade Jorge, Hoover Paul, Kaminski Paul, Laimins Laimonis*. (2019) Topoisomerase IIβ-binding protein 1 activates expression of E2F1 and p73 in HPV positive cells for genome amplification upon epithelial differentiation. Oncogene 2019 Apr;38(17):3274-3287. doi: 10.1038/s41388-018-0633-1. Epub 2019 Jan 10 PMCID: PMC6486426